一、什么是SD序列?其功能是什么?
SD序列是mRNA起始部位的碱基序列,为mRNA与核糖体的结合位点
因澳大利亚学者夏因(Shine)和达尔加诺(Dalgarno)两人发现该序列的功能而得名,在DNA上相应的位点也称SD序列,一般位于操纵基因和第一个结构基因之间,部分序列与操纵基因重叠。
在原核生物中,起始密码子的选择取决于核糖体的小亚基与mRNA模板之间的相互作用。
扩展内容:
SD序列的作用:
1、30S亚基与处于紧靠正确起始密码子上游的富含嘌呤的mRNA模板结合,它与16S rRNA 3'端的一个富含嘧啶区互补。
2、当mRNA中的SD序列于16S rRNA上的反SD序列结合后,就指示了下游的AUG,即是蛋白质合成的起始密码子。
参考资料来源:百度百科-SD序列
二、SD序列名词解释是什么
Shine-Dalgarno (SD)是细菌和古细菌中信使RNA中核糖体结合位点序列。通常位于翻译起始密码子AUG上游约8~10个碱基位置。
SD序列帮助招募核糖体RNA,并将核糖体比对并结合到信使RNA(mRNA)的起始密码子,从而开始蛋白质合成。一旦被招募,tRNA可以按照密码子的指令顺序添加氨基酸,从翻译起始位点向下游移动进行蛋白质合成。
扩展资料
SD序列与起始密码子之间的精确距离保证了mRNA在核糖体上定位后,翻译起始密码子AUG正好处于核糖体中的P位,这是翻译启动的前提条件。在很多情况下,SD序列位于AUG之前大约7个碱基处,在此间隔中少一个或多一个碱基,均会导致翻译起始效率不同程度的降低。
大肠杆菌中的起始tRNA分子可以同时识别AUG、GUG和UUG3种密码子,但其识别频率并不相同,通常GUG为AUG的50%,而UUG只及AUG的25%。mRNA 5'端非编码区自身形成的特定二级结构能协助SD序列与核糖体结合,任何错误的空间结构均会不同程度地削弱mRNA于核糖体的结合强度。
参考资料来源:百度百科-SD序列
三、sd序列名词解释是什么?
夏因-达尔加诺序列(英语:Shine-Dalgarno sequence,常简称为SD序列)是由澳大利亚科学家约翰·夏因与琳·达尔加诺所提出的一个存在于信使RNA上的核糖体结合位点,通常位于起始密码子AUG的上游的八个碱基对处。
夏因-达尔加诺序列只存在于原核生物中。六个碱基的共有序列是AGGAGG;例如,在大肠杆菌中,这个序列为AGGAGGU。该序列帮助动员核糖体结合到信使RNA上并将其校准到起始密码子上以启动蛋白质生物合成。
该序列的互补序列(CCUCCU)被称为反夏因-达尔加诺序列,它位于核糖体中16S 核糖体RNA的3'端:以大肠杆菌为例,反夏因-达尔加诺序列位于其16S核糖体RNA的第1534~1540号核苷酸左右处。真核生物中与夏因-达尔加诺序列相等价的序列被称为科扎克共有序列。
引导翻译起始
当夏因-达尔加诺序列与反夏因-达尔加诺序列配对时,翻译起始因子:IF2-三磷酸鸟苷、IF1和IF3,连同起始子转移RNA——N-甲酰甲硫氨酸-转移RNA(fmet)都被动员到核糖体上,以完成翻译起始阶段。
之后,就需要将夏因-达尔加诺序列隔离起来,其原因有二:
第一、核糖体必须释放信使RNA的5'尾部以便向前(3'端)移动,否则会拖着5'尾部一起移动;
第二、在核糖体与给定信使RNA的翻译过程中必须阻止新一轮夏因-达尔加诺序列介导的启动信号触发行为。